CLOUD云在设计和部署MySQL数据库时，是否将数据库服务器与应用服务器分开，取决于多种因素，包括但不限于性能需求、安全性考虑、成本预算以及管理复杂度等。结论是：对于中大型应用或对性能和安全有较高要求的应用来说，将MySQL数据库服务器与应用服务器分开是有必要的；而对于小型应用或者初期项目，可以考虑合并在同一台服务器上，以降低成本和简化管理。
性能考虑
当应用程序和数据库位于同一台服务器上时，两者会竞争相同的计算资源（如CPU、内存和I/O），这可能导致性能瓶颈，尤其是在高并发访问的情况下。将MySQL数据库服务器独立出来，可以确保数据库拥有足够的资源来处理查询，从而提高整体系统的响应速度和吞吐量。
安全性考虑
从安全角度来看，将数据库服务器与应用服务器分离可以提供更好的隔离效果。即使应用服务器遭受攻击，攻击者也难以直接访问到数据库服务器，降低了数据泄露的风险。此外，独立的数据库服务器可以更灵活地配置防火墙规则，限制只有特定的IP地址或子网能够访问数据库，进一步增强了安全性。
成本与管理
对于小型项目或初创企业而言，初期可能面临资金紧张的情况，此时将应用服务器和数据库服务器合并可以有效减少硬件投入和运维成本。然而，由于业务的增长，这种架构可能会逐渐暴露出性能瓶颈和安全隐患，因此适时地进行拆分是必要的。在管理和维护方面，独立的数据库服务器虽然增加了系统复杂度，但也使得数据库的备份、恢复、监控等工作更加方便和高效。
可扩展性和灵活性
将MySQL数据库服务器独立出来后，未来更容易实现水平扩展（如读写分离、主从复制）或垂直扩展（增加服务器性能）。这对于需要支持大量用户访问、处理海量数据的应用尤为重要。同时，独立的数据库服务器还可以根据实际需求选择更适合的硬件配置，比如更高的内存容量、更快的存储介质等，以优化数据库性能。
综上所述，是否将MySQL数据库服务器与应用服务器分开，应基于具体的应用场景、业务需求和技术条件综合考量。对于大多数中大型应用而言，分离架构是更为合理的选择。